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服务器使用说明

基本信息
服务器账号、登录地址和可用计算资源由管理员单独分配。首次使用前请联系管理员开通账号,并确认个人数据目录、存储配额和 GPU 使用权限。

本页主要记录登录、文件传输、软件环境、存储规范和常见问题。具体服务器配置会随平台维护调整,不在页面中固定写死。

登录方法

使用 SSH 登录服务器,初始账号由管理员分配:

ssh 用户名@服务器地址

Windows 用户推荐使用 MobaXtermVS Code Remote-SSH 插件登录。

建议配置 SSH 密钥登录,避免每次输入密码。生成密钥:ssh-keygen -t ed25519,然后将公钥发给管理员。
请勿将账号密码告知他人,离开时锁定终端。
文件传输

上传文件(本地 → 服务器):

scp 本地文件路径 用户名@服务器地址:远程路径
# 例:scp data.tar.gz user@192.168.x.x:/data1/user/

下载文件(服务器 → 本地):

scp 用户名@服务器地址:远程文件路径 本地路径

也可使用图形化工具 FileZilla(SFTP 协议,端口 22)。

软件环境

服务器已安装以下常用工具(具体版本请联系管理员):

  • Conda / Miniconda — 建议每人创建独立虚拟环境
  • Python 3.x、R 4.x
  • 常用生信工具:(待补充,例:STAR、GATK、samtools 等)
  • CUDA / cuDNN(GPU 节点)

激活 conda 环境:

conda activate 环境名
不要在 base 环境中安装包,为每个项目创建独立环境。
存储规范
  • 个人目录:/home/用户名/,请勿存放大文件
  • 数据目录:/data1/用户名/,用于存放原始数据和结果
  • 共享数据:/data1/shared/,公共参考基因组等资源
重要数据请及时备份,服务器不保证数据安全。定期清理无用的临时文件。
使用规范
  • 长时间计算任务请使用 nohupscreen / tmux 后台运行
  • 高负载任务请提前告知管理员,避免同时运行多个大型任务影响他人
  • 禁止在服务器上进行与科研无关的挖矿、爬虫等操作
  • 不得安装来源不明的软件
常见问题

Q:SSH 连接超时怎么办?

~/.ssh/config 中添加:

Host *
    ServerAliveInterval 60
    ServerAliveCountMax 3

Q:conda 命令找不到?

source ~/.bashrc
# 或
/opt/miniconda3/bin/conda init bash && source ~/.bashrc

Q:磁盘空间不足?

使用 du -sh /data1/用户名/ 查看占用,清理不需要的中间文件。如确需扩容请联系管理员。

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联系管理员

邮箱:lijie@kmmu.edu.cn

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